In der Mittelstufe (Klassen 5 und 6)  liegt in Deutsch ein Schwerpunkt in der Verbesserung der Lesekompetenz.

Sowohl in der 5. als auch in der 6. Klasse werden diagnostische und informelle Tests durchgeführt, um das aktuelle Leseniveau zu bestimmen und entsprechende individuelle Fördermaßnahmen zu entwickeln.
Um das Lesen zu unterstützen besuchen die Schülerinnen und Schüler in der Regel die Stadtbibliothek mit einer Führung und können dort, wenn es von den Erziehungsberechtigten gewünscht ist, sich einen Leseausweis erstellen lassen.
Des Weiteren gibt es an der Ernst-Elias-Niebergall Schule eine gut ausgestattete Schülerbibliothek.
In der 6. Klasse wird ein Vorlesewettbewerb mit den jeweiligen Klassensiegern der 6. Klassen durchgeführt.

Ab der 5. Klasse wird der Arbeitslehreunterricht installiert. Dazu gehören die Fächer ‚Hauswirtschaft Kochen‘, ‚Informations- und kommunikationstechnische Grundbildung‘, ‚Werken mit Holz‘ und Textiles Gestalten‘. Diese Fächer dienen schon als Einblicke für die spätere Berufsvorbereitung.

Eine Besonderheit in der 5. Klasse ist die Radfahrausbildung.
Die Schülerinnen und Schüler haben die Möglichkeit den Theorieunterricht gemeinsam mit der Klassenlehrerin/dem Klassenlehrer zu erarbeiten.
In der Jugendverkehrsschule in Bessungen findet der Praxisteil statt, indem die Schülerinnen und Schüler mit dort geliehenen Fahrrädern in einem Fahrradparcours die gelernte Theorie in die Praxis umsetzen. Zum Abschluss der Übungseinheiten findet die Fahrradprüfung statt.

Über das Schuljahr verteilt runden verschiedene Ausflüge in Darmstadt und Umgebung, eine Klassenfahrt und Projekttage zu verschiedenen Themen, sowie Feste und Feiern das Angebot der Mittelstufe ab.